深夜，本該無人的郊外卻傳來陣陣用鋤頭挖土的聲音，仔細看去，一名身形略顯肥胖的男子正在用力挖土，而男子旁邊正放著一名男子的尸體！清晨，一輛本該進站的209公交車卻突然駛向人群，難以控制，就在車子快要撞向人群時，幸好剎住了車。
周圍的人們見狀連忙用力打開車門，準備營救乘客，卻發(fā)現(xiàn)車內(nèi)乘客包括司機已經(jīng)口吐白沫身亡。一名男子匆匆走進一幢寫字樓，按下電梯，來到自己的辦公間，原來這名男子叫查理。查理在辦公桌前坐下，電腦上顯示收到一封新郵件，點開一看上面寫著：我知道你做了什么。
查理回復(fù)了郵件：你是誰。對方回答：目擊者！對方繼續(xù)發(fā)來郵件要求查理幫其辦事，查理拒絕了。此時，查理手邊新到的包裹里傳來一陣手機鈴聲，查理找到手機并接起。對方傳來一個男人的聲音，對方用查理的女兒喬琳威脅查理幫助他去一個地方拿走一臺筆記本電腦。
同時，特別行為分析組的五名組員和新加入的成員塔拉博士正在前往洛杉磯的飛機上分析著案件，警方已經(jīng)確認全部受害者死于沙林毒氣，組員們認為這很可能是邪教組織恐怖分子報復(fù)政府的“杰作”。小組成員來到案發(fā)現(xiàn)場，警員們找到了一個自制的使毒氣延時釋放的裝置，由此可以推論兇手謀劃這次案件很久，戴夫認為這并不是團伙作案而且沙林毒氣也很有可能是自制的，因此他們將目標鎖定在了化學(xué)家，并找到一名嫌疑人——約翰·蓋特曼。
同時，警方通過翻查案發(fā)現(xiàn)場的監(jiān)控認為查理曾出現(xiàn)在現(xiàn)場并且行為詭異！夜晚，查理將車停在停車站，步行來到一座房子前，他悄悄走進屋內(nèi)，拿起桌上的筆記本轉(zhuǎn)身就走，卻發(fā)現(xiàn)一個人正躲在簾子后面，他扒開簾子一看，竟是一名陌生男子的尸體！
一個小時后，警方接到報警來到這所房子，發(fā)現(xiàn)死者正是約翰·蓋特曼！通過翻看停車站的監(jiān)控，組員發(fā)現(xiàn)查理曾經(jīng)出現(xiàn)在這里。第二天清晨，查理又接到了神秘男子的來電，要求查理取一個包裹。同時，小組成員召開了案件的新聞發(fā)布會和完成了兇手的部分特寫。
戴夫和摩根來到查理的公司，通過詢問查理的妻子，警員們得到了想要的訊息猜想出查理殺死了西奧，并通過調(diào)查西奧牽扯出西奧的哥哥米切爾。查理來到制定地點取到包裹，打開一開，里面竟是一個防毒面具和一套防化服。正在這時，神秘男子又打來電話，查理與其激烈爭吵，神秘人又用喬琳威脅查理，正在這時，查理發(fā)現(xiàn)旁邊駛過的黑車轎車里的一個身影很像喬琳，他連忙開車追了上去。
警方通過調(diào)查發(fā)現(xiàn)了西奧和米切爾與一個邪教組織的關(guān)系，并進一步得出結(jié)論：米切爾與西奧關(guān)系破裂并目擊到查理查理殺死西奧并找查理充當(dāng)替罪羊。正在這時，查理開車想要沖進聯(lián)邦公安局，警員們打開查理的轎車后備箱，發(fā)現(xiàn)了一大堆毒氣泄漏裝置，警員們明白了這是米切爾的陰謀。
小組成員們通過監(jiān)控追蹤到了米切爾的位置，正前往抓捕。而此時的米切爾正在對面的天臺上等著愜意的觀看他制造出的混亂，突然身后多了一把槍，米切爾不得不投降。一切都歸于平靜，但是查理因為故意殺人而不得不受到法律的懲罰。
在回程的飛機上，非凡博士和塔拉博士正在愉快的交談，不時傳來一陣歡聲笑語···
